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新论文:生态学中的移除模型-系统综述

SE@K成员Oscar和Rachel发表了一篇论文,回顾了当前建模去除数据的最先进技术。这项工作是EPSRC项目EP/S020470/1的一部分“模拟移除和重新引入数据以改善保护”。

这篇论文全文可在这里获得:https://journals.plos.org/plosone/article/authors?id=10.1371/journal.pone.0229965

生态学中的迁移模型:系统综述

奥斯卡·罗德里格斯·德·里维拉和瑞秋·麦克雷

移除模型在80多年前被提出,作为估计未知种群规模的工具。最近,它们被用作控制不受欢迎物种的管理行动或评价迁移管理行动的有效工具。虽然模型随着时间的推移而发展,但从本质上讲,数据收集的方案保持相似:在每次采样时,都试图从研究区域捕获和移除个体。在本文中,我们回顾了迁移建模的文献,并重点介绍了迁移数据分析方法的发展,以便为希望实施这些方法的生态学家提供统一的资源。删除数据的模型已经开发出来,以更好地适应数据的重要特征,我们讨论了实现模型所需假设的变化。这种类型的数据和相关模型的相对简单性意味着该方法仍然具有吸引力,我们讨论了该技术未来的潜在作用。

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新论文:隐藏马尔可夫模型的底层状态结构的检验-部分观测捕获-再捕获数据

前SE@K博士生Anita Jeyam, Rachel和Roger Pradel(蒙彼利埃)发表了一篇论文,提出了一种确定隐马尔可夫模型底层状态结构的新测试。这是一项令人兴奋的工作,它为解决一般嗯哼的复杂主题提供了基础。

全文可在https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fevo.2021.598325/full上开放获取

隐马尔可夫模型底层状态结构的检验-部分观测捕获-再捕获数据

隐马尔可夫模型(hmm)在生态建模领域得到了广泛应用。
然而,确定HMM中的底层状态的数量仍然是一个挑战。
在这里,我们研究了开放种群的捕获-再捕获模型的一个特殊情况,
观察到一些动物,但不可能确定它们的状态(部分
观察),而其他动物的状态分配没有错误(完整
观察)。我们提出了底层状态结构生成的混合测试
部分观测,评估它们是否与集合相兼容
在完整观测中观测到的状态。我们展示了良好的表现
通过模拟和应用于加拿大鹅的数据集,对试验进行了分析。

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新论文:对繁殖种群的出生队列的建模招募:隐马尔可夫方法

来自圣安德鲁斯和爱丁堡的雷切尔·麦克雷及其合著者发表了一篇关于灰海豹招募过程建模的论文。

全文可在https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fevo.2021.600967/full上开放获取

繁殖种群中出生队列的建模招募:隐马尔可夫方法

沃辛顿,金,麦克雷,斯莫特和波默罗伊

长期捕获-再捕获研究为研究长寿物种在个体成熟和成年期间的种群动态提供了机会
时间。我们考虑在雌性灰海豹队列上收集的捕获-再捕获数据
(Halichoerus grypus)生于20世纪90年代,后来在岛上观察到繁殖
五月,苏格兰福斯湾。雌性灰海豹可以活30年以上,但不能炫耀
它们成熟率的个体差异,因此被招募到繁殖群体中
不同年龄段的人。理解个体隐藏的部分过程
从未成熟到繁殖成员的过渡,特别是鉴定
随着时间的推移,这一过程的任何变化对于理解这些因素都很重要
影响该物种种群动态的。非自治再
模型可以明确地将招聘和其他感兴趣的人口参数联系起来,
个人的年龄和/或时间。负责对封条的监控
我们考虑了几个出生队列的年龄结构模型,其中包含了特定的
cohort-structure。在这个模型中,我们着重于分布的估计
这个殖民地繁殖种群的招募年龄。理解这个
招聘过程,并确定这一过程中的任何变化或趋势,将提供
洞察个别年份的影响,并给出一个更现实的招聘概况
目前英国灰海豹种群模型。隐马尔可夫模型的使用提供了一个
遵循个体真实潜在状态的进化的直观框架。
该模型分解了系统的不同过程:招聘进入
繁殖种群;生存而生存;以及相关的观察过程。这个模型
规范为关联的模型提供了显式和紧凑的表达式
模型拟合的效率。此外,这个框架自然会导致更多的扩展
复杂的模型,例如首次繁殖和返回繁殖的分离,通过
对模型的数学结构进行相对简单的更改。

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