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亚历克斯在《环境计量学》上发表的新论文

利用捕获-再捕获数据建模物种之间和物种内部相互作用的点过程向量

亚历克斯戴安娜Eleni Matechou吉姆·e·格里芬Yadvendradev JhalaQamar库雷希

摘要

在检测概率小于1的情况下,捕获-再捕获(Capture-recapture, CR)数据及其模型已被广泛应用于估算野生动物种群规模。当用于捕捉或探测个体的陷阱或摄像机的位置已知时,使用空间显式CR模型来推断个体位置和种群密度的空间格局。个体位置,称为活动中心(ac),被定义为个体移动的位置。这些ac通常被认为是独立的,它们的空间模式是使用齐次泊松过程建模的。然而,这种假设通常是不现实的,因为个体之间可以相互作用,无论是在一个物种内部还是不同物种之间。在本文中,我们从一般相互作用的点过程和点过程中考虑一个向量开发一个CR数据模型,可以解释多个物种之间和内部的相互作用,特别是排斥.交互点过程从推理的角度提出了一个挑战,因为似然函数的归一化常数难以处理,因此不能应用标准的马尔可夫链蒙特卡罗程序来执行贝叶斯推理。因此,我们采用了一种基于蒙特卡罗大都会黑斯廷斯算法在对多个物种建模时,这个模型的比例很好。最后,我们采用推理方法根据出生和死亡过程联合采样潜在ac和种群大小.这种方法也允许我们灵活调整新点的提案分布,这导致了更好的混合,特别是在非均匀分布的陷阱的情况下。我们将该模型应用于aCR关于豹子和老虎的数据集在印度的科比特老虎保护区收藏。研究结果表明,老虎种群密度高于豹子种群密度,且种间排斥强于种内排斥。

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Eleni及其同事在JABES上发表的新论文

由Eleni Matechou, Stephen N. Freeman和Richard Comont撰写的题为“大黄蜂中特定种姓的人口统计学和物候学:建模BeeWalk数据”的论文可供参考开放获取。

这项工作提出了新的动态混合模型,用于在前所未有的地理规模上监测大黄蜂种群,由英国公民科学BeeWalk推动。

这些模型让我们第一次从公民科学数据中估计大黄蜂的物候和季内生产力,定义为该年每个群体中每个种姓的个体数量。

所有这些参数都是为每个等级单独估计的,为研究野外群居昆虫复杂生命周期的时间变化提供了相当大的生态细节。由于模型的动态性质,我们能够使用可用的时间序列产生一些英国大黄蜂物种的种群趋势。通过一个额外的模拟练习,我们展示了如果调查继续进行,并如预期的那样扩大规模,有用信息将增加的程度。

大黄蜂是生态系统中极其重要的组成部分,提供具有巨大经济影响的授粉服务,并作为气候或土地利用变化的指示物种。我们的研究结果证明了几年之间物候和生产力的变化,并为监测大黄蜂种群提供了宝贵的工具,在英国和世界各地,许多大黄蜂种群都在下降。

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cormark - jolly - seber模型50周年纪念

就在50多年前,出现了三篇论文,分别描述了分析捕获-再捕获数据的基本方法。它现在被称为科马克-乔利-塞伯模型。这一周年纪念是在第二期开云体育网址统计科学, 2016年,史蒂夫·巴克兰和拜伦·摩根客串编辑。它的特点是对乔治·塞伯和理查德·科马克的采访转录。此外,还有八篇研究论文展示了捕获-再捕获领域如何仍在发展,并将其应用于遗传学、社会和医学领域以及生态学。

史蒂夫瑞秋拜伦

照片中,史蒂夫向圣安德鲁斯大学的理查德(Richard)赠送了一份杂志,该杂志两篇论文的合著者雷切尔·费斯特(Rachel Fewster)向奥克兰大学的乔治(George)赠送了一份开云体育主頁(欢迎您),拜伦(Byron)向乔治·乔利的两个女儿希瑟·汉娜和菲奥娜·戴维斯(Fiona Davies)赠送了两份。第三份属于他们的兄弟大卫·乔利,他住在沙特阿拉伯。

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雷切尔和拜伦在《皇家统计学会杂志》C系列(应用统计学)上发表了一篇论文。开云体育网址

捕获-再捕获诊断模型评估新策略

在捕获-再捕获测试和分数测试中使用的诊断测试的共同思想是,从简单的基本模型开始,可以查询数据,以确定是否支持更复杂的参数结构。目前的建议建议诊断测试作为模型选择步骤的前导。我们表明,某些著名的用于检查捕获-再捕获模型对数据的拟合的诊断测试实际上是分数测试。由于这种直接关系,我们研究了一种新的模型评估策略,该策略将偏离基本模型假设的诊断与模型选择的逐步提升相结合,所有这些都基于分数测试。我们研究了这种方法在检测缺乏模型拟合的常见原因方面的能力,并通过模拟将这种新策略的性能与现有建议进行了比较。我们用真实的数据展示了激励的例子,与诊断测试相比,分数测试的额外灵活性导致了更好的表现。

论文全文pdf可在以下网址浏览:http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/rssc.12197/pdf

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出版物

Eleni, Rachel, Byron及其同事的新论文

应用统计学年鉴
2016, Vol. 10 No. 3, 1572-1589
DOI: 10.1214 / 16-aoas949
©中国数理统计研究所,2016

为删除数据开放模型

作者:埃莱尼·马特丘,雷切尔·s·麦克里,拜伦·j·t·摩根,
达林·j·纳什和理查德·a·格里菲斯

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受保护物种的个体,如两栖动物和爬行动物
需要在开发开始前从工地移走。通常,
人口被认为是封闭的。假设所有个体都是(i)
存在并可在研究期开始时检测到,并且(ii)保留
直到研究结束,除非他们被检测到。然而,
人口封闭的假设并不总是有效的。我们提出
新的迁移模式,允许通过出生和/或种群更新
移民,人口减少通过抽样和
死亡/移民。在适当的时候,可以估计生产率,并计算
贝叶斯方法允许估计总体概率
损耗。我们使用数据来演示模型的性能
普通蜥蜴(zotoca vivipara)和大冠蝾螈(Triturus cristatus)。

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