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NERC高级培训课程

开云体育网址野生动物种群评估和保护的统计模型

2017年1月9日至13日

开云体育主頁(欢迎您)肯特大学开云体育app客服

申请截止日期:2016年10月14日星期五下午5点。

我们有30个全额资助名额(包括旅行和住宿),优先考虑nerc资助的博士学生,但如果空间仍然存在,我们能够向其他博士学生和早期职业研究人员提供资助名额。

请将填妥的申请表R.S.McCrea@ken开云体育app客服t.ac.uk。

在环境部门内,目前缺乏具备统计建模技能以进行可靠的人口评估的从业人员。开云体育网址因此,环境影响评估和发展减缓项目经常使用不适合目的的人口评估方案1.出现技能短缺的原因是:(1)人口评估统计模型的最新进展主要局限于学术部门,对最终用户的渗透很少;开云体育网址(2)尽管许多研究生课程都有统计建模训练的组成部分,但这往往不能让博士生接触该领域的新模型以及这些模型在保开云体育网址护实践中的潜在应用2.该培训计划将为博士研究生和早期职业研究人员/从业人员提供涉及野生动物种群保护评估的职业所需的相关建模技能。

  1. 格里菲斯,福斯特,威尔金森和休厄尔(2015)。科学、统计和调查:爬虫学的观点。应用生态学杂志.doi: 10.1111 / 1365 - 2664.12463
  2. 麦克雷和摩根(2015)。捕获-再捕获数据分析。查普曼和霍尔/CRC出版社,佛罗里达州。

课程计划

研讨会将集中讨论在保护实践中出现的生态问题,并使用真实的案例研究数据。培训将包括基于个体的模型,如捕获-再捕获,但也将包括EIA中更常用的场景,如批量标记、存在/缺席、场地占用和计数。申请者包括蝾螈、蝴蝶、鸟类、蜜蜂、甲虫、野山羊和蝙蝠。每个模块都将配有一个使用R语言的实用计算机会话,每个模块都建立在上一个模块的基础上,以便代表们建立一个统计技能组合。开云体育网址

培训结果:在课程结束时,参加者将能够:

  • 构建、解释和拟合相关随机模型,使用不同的推理方法,了解贝叶斯和经典方法的优缺点以及先验信息的使用;
  • 个性化R代码,对自己的研究数据进行建模;
  • 了解环境影响评估及保育所需的动物种群评估数据;
  • 分析动物种群数据,以满足保育和商业需要。

草案的时间表:

模块1有统计学和R的背景(周一下午)
  • 似然与概率论
  • 贝叶斯推理
  • 基本模型评估(AIC/绝对GOF)
  • 实践环节:简介

全体会议和圆桌讨论(周二上午)

模块2:理解统计不确定性开云体育网址(周二下午)
  • 不完美的检测
  • 数据类型、关系和摘要。
  • 数据集/案例研究简介(蜜蜂、蝴蝶、蝾螈、野鸭等)
  • 实践环节:转换数据格式,总结复杂数据。

单元3:模型拟合与评估(周三上午+下午)
  • 估计数量
  • M0、Mtbh去除
  • CR / RR
  • 入住率
  • 实践环节:模型拟合,优化,包的使用。

单元4:现代挑战(周四上午)
  • 公民科学数据
  • 小/稀疏数据和大数据问题
  • 研究设计的成本效益和统计能力。开云体育网址
  • 翔实的先验信息。
  • 实践环节:权力分析和适应模型

模块5:高级随机建模(周四)下午
  • 造型运动
  • 状态的不确定性
  • 物种相互作用
  • 空间模型
  • 集成建模
  • 实践部分:使用Rjags,使用MCMC的贝叶斯图形模型。

一对一咨询(周五上午)

单元6:R的高级方面(周五上午)
  • 实践环节:自我引导工作表
  • 多态实例
  • 人力资源诊断
  • 诊断性GOF测试
标准
会议

SE@K在ISEC

Byron, Diana, Eleni, Emily, Ming和Takis参加了6月28日至7月1日在西雅图举行的国际统计生态学会议。开云体育网址

6月28日,Eleni在丰度估计的贡献会议上谈到了用于移除数据的开放模型。演讲的幻灯片

talk1

在同一个会议上,艾米丽谈到了蝴蝶数量的最新模型的扩展。

6月29日,拜伦在全体会议上发表了题为“公民科学,不给糖就捣蛋”的演讲。

同样在6月29日,塔基斯在丰度估计的第二届贡献会议上发表了关于间接调查方法中衰减符号时间的高效、灵活估计的演讲。

在同一场会议上,Ming做了一个关于爬行动物和两栖动物的新清除方法的演讲。

然后Eleni在关于丰度估计的第三次会议上,就使用稳健设计收集的计数数据进行了第二次演讲。演讲的幻灯片

talk2

同一天晚些时候,戴安娜在一个关于捕获-再捕获的贡献会议上发表了关于符号-数字混合方法的扩展,用于调查可识别性。演讲的幻灯片

DianaTalkimage

标准
论文

论文:离散状态空间和集成模型的参数冗余

Diana和Rachel的论文,离散状态空间和集成模型中的参数冗余,可以在生物计量杂志http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/bimj.201400239/abstract上在线获得

摘要在生态学中,离散状态空间模型用于描述野生动物种群的动态,其参数如生存概率具有生态利益。对于模型的特定参数化,并不总是清楚可以估计哪些参数。这种无法估计所有参数的情况被称为参数冗余,或将模型描述为不可识别的。在本文中,我们开发了可以用来检测离散状态空间模型中的参数冗余的方法。详尽的摘要是完全指定模型的参数的组合。要使用一般方法来检测参数冗余,需要一个适当的详尽总结。本文提出了用连续状态空间模型方法的离散类似物推导离散状态空间模型的穷举总结的两种方法。我们还证明,通过使用集成总体模型组合多个数据集,可以得到一个所有参数都可估计的模型,即使拟合到单独数据集的模型可能是参数冗余的。

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