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布鲁诺和埃莱妮参观了斯德哥尔摩

这次访问是他们与Eleonora Mussino博士合作的瑞典研究委员会资助的人口登记过度覆盖建模项目的一部分。

这个项目的第一篇论文已经在审查中,使用多系统估计来估计每年在任何登记册中都没有观察到的现有移民数量。

他们目前正在开发捕获-再捕获-恢复模型,其中临时移民作为一种替代方法,用于估计一个人在那里的概率,前提是他们没有被观察到。

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Eleni与NatureMetrics授予知识转移合作伙伴关系

NatureMetrics是一家创新的、以科学为基础的、由女性领导的中小企业,致力于大规模商业化环境dna生物多样性监测解决方案。他们在提供强大、可扩展的生物多样性数据方面处于世界领先地位,这些数据是使用环境DNA安全、可持续地收集的。NatureMetrics致力于开发用于生物多样性检测的端到端自动化工具,供非专家使用。

该KTP旨在开发和整合新的统计技术,以解决与使用环境DNA进行生物多样性调查相关的两个开云体育网址挑战:环境DNA调查中的误差和噪声,以及优化调查设计。这些技术将改善企业在自然保护和恢复方面的决策支持工具,促进进入新市场。

NatureMetrics的使命是通过使用尖端的DNA分析来监测生物多样性和测量环境中的自然资本,弥合分子技术和环境管理之间的差距,而这个KTP将使他们能够实现这一使命。

具体来说,这个KTP的目的是嵌入肯特大学(Eleni Matechou博士)和伦敦大学学院(Jim Griffin教授)的学者开发的贝叶斯分层统计模型的新知识和能力。开云体育网址开云体育主頁(欢迎您)开云体育app客服通过这个KTP,这些技术将被整合到NatureMetrics的分析工作流程中,使他们能够提高下游产品中所调查的生物群落(即一个地点的物种集合)存在/不存在或相对丰富程度的置信水平。这将优化收集和分析样本所需的成本和精力。

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nerc资助的“将新的统计框架整合到景观尺度的eDNA调查和分析”项目开云体育网址

由NERC资助的项目,由Eleni Matechou博士领导,与兰开斯特大学的Alex Bush博士,伦敦大学学院统计科学的Jim Grif开云体育主頁(欢迎您)fin教授,肯特大学Durrell保护与生态研究所的Richard Griffiths教授和东安开云体育网址格利亚大学Doug Yu教授作为共同研究员,是NERC景观决策战略优先基金的一部分:面向土地资产使用计划的新框架。开云体育app客服

该项目的RA有效期至2022年1月31日,将致力于实现该项目的四个模型开发目标和两个实施和知识交流目标。

模型开发(MD)目标:
MD1解释基于dna的数据中的抽样和分析误差和分类不确定性
单物种(条形码)和多物种(元条形码)DNA数据集具有比数据更复杂的特性
使用传统技术收集,使用视觉、听觉或物理观察。例如,eDNA调查容易
采样和分析阶段的假阳性和假阴性误差以及分类错配。我们
将开发新的统计模型,解释eDNA数开云体育网址据的概率性质,可靠地量化所有水平的
eDNA调查的不确定性。

MD2确定对特定地点物种组成和元群落结构的重要景观预测因子
物种存在概率、物种相互作用和元群落结构受到景观的影响
特征。解释这些影响对于了解系统以及如何维护系统是必要的
或者改进它。不考虑重要的影响会导致不准确的推断和有偏见的结果。然而,
这些影响的强度和方向通常是未知的,我们将开发一个新的贝叶斯建模框架
以及在物种和元群落水平上有效推断景观效应的复杂算法
埃德娜的数据。

进行模拟,以确定不同情况下基于dna的调查的最佳研究设计
使用eDNA数据正确推断元群落结构和景观效应的能力
取决于取样的位点数量,从每个位点收集的样本数量,PCR重复次数
对每个样本以及景观特征进行了分析。我们将进行大量的模拟来识别
优化的研究设计在不同的场景和错误水平下,为从业者提供如何知情的指导方针
设计eDNA调查。

MD4确定调查数据中的错误或次优研究设计对保护优先级选择的影响(例如;
高价值生境或恢复优先次序)

现有的一些保护规划软件旨在推断最有效的资源分配。我们的贝叶斯
MD1-2定义的模型和MD3的功率分析为物种的预测提供了有价值的工具
存在和元社区结构,与相应的不确定性措施,在整个景观。使用
在我们的英国池塘案例研究系统中,通过拟合模型产生的预测,我们将获得并比较不同的
规划软件提供的解决方案经常用于决策过程,并评估如何和是否
当推理中的不确定性被明确地解释时,决策就被告知了。

实施和知识交流(IKE)的目标:

开发R-Shiny应用来实现MD1-4,使用户可以访问它们
新的eDNA数据开云体育网址统计框架(MD1-4)将实现到R-Shiny应用程序中,并伴随着
数据分析的例子和相应的解释,使从业者有有限的了解统计
并且在分析eDNA数据时没有编程知识。

IKE2通过培训研讨会和项目合作伙伴向用户传播项目成果和软件
在MD1-4和IKE1结束后,我们将在项目的最后一个季度组织两次培训研讨会
完成向研究用户传播新方法。这些活动将补充目前正在进行的、已全部订阅的活动
研究团队一直在为eDNA和统计学一般领域的从业者举办培训研讨会开云体育网址
造型。

关于该项目的更详细的描述可以在这里找到在这里

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Eleni授予皇家学会国际交流基金

Eleni Matechou博士被授予12000英镑的项目,该项目名为“移民路线上收集的生态数据的新型统计建模框架”,是皇家学会国际交流计划的一部分,与开云体育网址意大利罗马大学萨皮恩扎的Alessio Farcomeni教授合作开云体育主頁(欢迎您)

该项目将于2019年8月19日开始,为期两年。

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SE@K项目荣获科学系竞赛奖学金

该项目名为利用贝叶斯非参数模型研究英国鸟类种群的迁徙模式,是由Eleni Matechou博士和来自英国的Alison Johnston博士合作提出的鸟类学信托基金会和SMSAS的吉姆·格里芬教授。

建议摘要:这个合作项目的博士生将开发和使用新颖和复杂的统计模型,即贝叶斯非参数模型,以了解英国鸟类迁徙的模式。开云体育网址要分析的数据是指在英国繁殖、在非洲过冬的鸟类。这些数据由BTO收集,作为持续努力站点(CES)监测计划的一部分。分析将描述这些物种的迁移模式、物候、种群规模和分布。将探讨这些人口参数和环境协变量之间的联系,以解释导致模式和变化的机制(例如,气候变化导致早期移民)。研究结果也将用于保护管理策略。除了一些描述统计模型和生态过程的科学手稿外,该学生还将制作免费的软件,将来将由BTO和任何感兴趣的研究人员使用,以使模型适开云体育网址合他们自己的数据。

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